Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lpcat1Q3TFD2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lpcat1Q3TFD2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lpcat1Q3TFD2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lpcat1Q3TFD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lpcat1Q3TFD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lpcat1Q3TFD2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lpcat1Q3TFD2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms