Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDN2

Faf2, FAS-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf2Q3TDN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Faf2Q3TDN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Faf2Q3TDN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Faf2Q3TDN2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Faf2Q3TDN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Faf2Q3TDN2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Faf2Q3TDN2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms