Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmem104Q3TB48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem104Q3TB48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem104Q3TB48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem104Q3TB48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem104Q3TB48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms