Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Treml4Q3LRV9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml4Q3LRV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml4Q3LRV9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml4Q3LRV9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml4Q3LRV9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms