Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vax1Q2NKI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vax1Q2NKI2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vax1Q2NKI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vax1Q2NKI2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vax1Q2NKI2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms