Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 14.1
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SAFBQ15424 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 515.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 14.1
SAFBQ15424 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 14.1
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SAFBQ15424 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 14.1
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SAFBQ15424 FAM182B-207ENST00000582267 832 ntTSL 515.97■□□□□ 0.154e-15■■□□□ 13.7
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SAFBQ15424 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 412.94□□□□□ -0.341e-6■■□□□ 13.4
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SAFBQ15424 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 223.72■■□□□ 1.396e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.316e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.156e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 520.97■□□□□ 0.956e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 520.36■□□□□ 0.856e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.746e-7■■□□□ 13.4
SAFBQ15424 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.496e-9■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.486e-9■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.626e-9■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 518.81■□□□□ 0.63e-6■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■□□□ 13.3
SAFBQ15424 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.187e-7■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.357e-7■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 36.48□□□□□ -1.377e-7■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.338e-49■■□□□ 13.2
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