Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim24Q0VG18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim24Q0VG18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim24Q0VG18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim24Q0VG18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms