Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cntnap5bQ0V8T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cntnap5bQ0V8T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cntnap5bQ0V8T8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap5bQ0V8T8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntnap5bQ0V8T8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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