Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab42Q0PD08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab42Q0PD08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab42Q0PD08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab42Q0PD08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab42Q0PD08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab42Q0PD08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms