Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
SobpQ0P5V2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
SobpQ0P5V2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
SobpQ0P5V2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
SobpQ0P5V2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
SobpQ0P5V2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
SobpQ0P5V2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
SobpQ0P5V2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
SobpQ0P5V2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
SobpQ0P5V2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
SobpQ0P5V2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms