Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TrioQ0KL02 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TrioQ0KL02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TrioQ0KL02 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrioQ0KL02 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrioQ0KL02 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrioQ0KL02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrioQ0KL02 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrioQ0KL02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms