Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc4Q08624 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc4Q08624 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc4Q08624 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc4Q08624 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc4Q08624 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc4Q08624 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc4Q08624 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc4Q08624 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc4Q08624 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc4Q08624 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc4Q08624 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms