Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Col17a1Q07563 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Col17a1Q07563 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Col17a1Q07563 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Col17a1Q07563 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Col17a1Q07563 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Col17a1Q07563 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Col17a1Q07563 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Col17a1Q07563 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Col17a1Q07563 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Col17a1Q07563 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Col17a1Q07563 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms