Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RelbQ04863 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelbQ04863 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelbQ04863 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RelbQ04863 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RelbQ04863 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelbQ04863 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RelbQ04863 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RelbQ04863 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RelbQ04863 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RelbQ04863 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RelbQ04863 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RelbQ04863 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RelbQ04863 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RelbQ04863 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RelbQ04863 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms