Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epha4Q03137 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epha4Q03137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epha4Q03137 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha4Q03137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha4Q03137 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha4Q03137 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms