Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb5Q02739 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb5Q02739 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb5Q02739 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb5Q02739 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb5Q02739 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb5Q02739 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb5Q02739 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb5Q02739 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb5Q02739 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb5Q02739 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms