Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja5Q01231 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gja5Q01231 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gja5Q01231 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gja5Q01231 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gja5Q01231 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja5Q01231 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gja5Q01231 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms