Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde1bQ01065 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pde1bQ01065 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pde1bQ01065 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde1bQ01065 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms