Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga4Q00651 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga4Q00651 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga4Q00651 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga4Q00651 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga4Q00651 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms