Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rbbp6P97868 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rbbp6P97868 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rbbp6P97868 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rbbp6P97868 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rbbp6P97868 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rbbp6P97868 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rbbp6P97868 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rbbp6P97868 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rbbp6P97868 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms