Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc35b1P97858 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc35b1P97858 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc35b1P97858 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc35b1P97858 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms