Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smad4P97471 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smad4P97471 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad4P97471 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad4P97471 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad4P97471 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad4P97471 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad4P97471 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad4P97471 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad4P97471 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad4P97471 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad4P97471 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smad4P97471 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad4P97471 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms