Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf3P70671 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf3P70671 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf3P70671 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf3P70671 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf3P70671 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf3P70671 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irf3P70671 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf3P70671 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf3P70671 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf3P70671 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf3P70671 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf3P70671 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf3P70671 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf3P70671 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf3P70671 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf3P70671 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf3P70671 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf3P70671 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf3P70671 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf3P70671 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms