Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp4P70343 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp4P70343 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp4P70343 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp4P70343 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp4P70343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp4P70343 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp4P70343 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp4P70343 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp4P70343 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp4P70343 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casp4P70343 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp4P70343 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp4P70343 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp4P70343 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp4P70343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms