Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrig1P70193 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrig1P70193 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig1P70193 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig1P70193 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig1P70193 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms