Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn5P68500 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn5P68500 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn5P68500 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn5P68500 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cntn5P68500 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntn5P68500 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn5P68500 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms