Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2l3P68037 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2l3P68037 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2l3P68037 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2l3P68037 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2l3P68037 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2l3P68037 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2l3P68037 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2l3P68037 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2l3P68037 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms