Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp3P63024 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp3P63024 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp3P63024 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp3P63024 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms