Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng7P62956 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng7P62956 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacng7P62956 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng7P62956 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng7P62956 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms