Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr3bP59470 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr3bP59470 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3bP59470 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3bP59470 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3bP59470 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3bP59470 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms