Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm2P58774 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm2P58774 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tpm2P58774 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm2P58774 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm2P58774 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm2P58774 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms