Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp1P58466 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp1P58466 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp1P58466 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctdsp1P58466 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms