Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snrpa1P57784 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Snrpa1P57784 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snrpa1P57784 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snrpa1P57784 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snrpa1P57784 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snrpa1P57784 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snrpa1P57784 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Snrpa1P57784 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms