Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctbp2P56546 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp2P56546 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp2P56546 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctbp2P56546 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctbp2P56546 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctbp2P56546 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp2P56546 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms