Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gp1bbP56400 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gp1bbP56400 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gp1bbP56400 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gp1bbP56400 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gp1bbP56400 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gp1bbP56400 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms