Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsc1P55849 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsc1P55849 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsc1P55849 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dsc1P55849 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dsc1P55849 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsc1P55849 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsc1P55849 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsc1P55849 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms