Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acod1P54987 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Acod1P54987 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acod1P54987 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acod1P54987 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acod1P54987 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acod1P54987 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acod1P54987 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acod1P54987 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acod1P54987 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms