Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NrlP54846 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NrlP54846 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NrlP54846 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NrlP54846 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NrlP54846 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NrlP54846 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NrlP54846 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NrlP54846 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NrlP54846 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NrlP54846 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NrlP54846 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NrlP54846 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NrlP54846 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NrlP54846 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NrlP54846 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NrlP54846 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NrlP54846 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NrlP54846 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NrlP54846 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NrlP54846 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NrlP54846 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NrlP54846 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NrlP54846 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NrlP54846 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NrlP54846 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NrlP54846 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NrlP54846 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NrlP54846 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NrlP54846 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NrlP54846 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NrlP54846 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NrlP54846 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NrlP54846 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NrlP54846 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NrlP54846 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NrlP54846 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NrlP54846 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NrlP54846 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NrlP54846 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrlP54846 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrlP54846 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NrlP54846 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NrlP54846 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NrlP54846 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrlP54846 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrlP54846 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NrlP54846 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NrlP54846 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NrlP54846 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrlP54846 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrlP54846 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrlP54846 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NrlP54846 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrlP54846 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrlP54846 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NrlP54846 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrlP54846 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrlP54846 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NrlP54846 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NrlP54846 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NrlP54846 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrlP54846 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrlP54846 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NrlP54846 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NrlP54846 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrlP54846 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrlP54846 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NrlP54846 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NrlP54846 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrlP54846 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrlP54846 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrlP54846 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NrlP54846 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NrlP54846 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NrlP54846 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NrlP54846 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrlP54846 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NrlP54846 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrlP54846 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NrlP54846 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NrlP54846 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrlP54846 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NrlP54846 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrlP54846 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrlP54846 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NrlP54846 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrlP54846 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NrlP54846 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NrlP54846 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms