Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ephb3P54754 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb3P54754 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ephb3P54754 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ephb3P54754 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ephb3P54754 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ephb3P54754 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ephb3P54754 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms