Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Faf1P54731 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Faf1P54731 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Faf1P54731 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Faf1P54731 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf1P54731 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf1P54731 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Faf1P54731 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf1P54731 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Faf1P54731 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Faf1P54731 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Faf1P54731 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Faf1P54731 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Faf1P54731 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Faf1P54731 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Faf1P54731 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms