Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc16a1P53986 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a1P53986 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc16a1P53986 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc16a1P53986 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc16a1P53986 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc16a1P53986 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc16a1P53986 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc16a1P53986 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc16a1P53986 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms