Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClgnP52194 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClgnP52194 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClgnP52194 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClgnP52194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ClgnP52194 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClgnP52194 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClgnP52194 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ClgnP52194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClgnP52194 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ClgnP52194 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClgnP52194 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClgnP52194 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClgnP52194 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms