Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ApodP51910 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApodP51910 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApodP51910 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApodP51910 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ApodP51910 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ApodP51910 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApodP51910 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApodP51910 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApodP51910 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApodP51910 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApodP51910 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApodP51910 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApodP51910 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApodP51910 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApodP51910 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ApodP51910 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApodP51910 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApodP51910 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApodP51910 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ApodP51910 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApodP51910 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApodP51910 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApodP51910 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApodP51910 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApodP51910 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApodP51910 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApodP51910 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApodP51910 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApodP51910 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApodP51910 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApodP51910 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ApodP51910 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApodP51910 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApodP51910 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApodP51910 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApodP51910 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ApodP51910 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApodP51910 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ApodP51910 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApodP51910 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ApodP51910 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ApodP51910 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApodP51910 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApodP51910 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ApodP51910 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ApodP51910 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApodP51910 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ApodP51910 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApodP51910 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApodP51910 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApodP51910 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ApodP51910 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApodP51910 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ApodP51910 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApodP51910 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApodP51910 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApodP51910 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ApodP51910 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApodP51910 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ApodP51910 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApodP51910 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApodP51910 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApodP51910 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ApodP51910 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApodP51910 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApodP51910 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ApodP51910 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApodP51910 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApodP51910 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ApodP51910 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApodP51910 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApodP51910 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApodP51910 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApodP51910 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ApodP51910 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApodP51910 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApodP51910 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApodP51910 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApodP51910 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApodP51910 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApodP51910 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ApodP51910 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApodP51910 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ApodP51910 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApodP51910 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApodP51910 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApodP51910 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ApodP51910 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApodP51910 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApodP51910 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ApodP51910 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApodP51910 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApodP51910 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms