Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd7P50283 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd7P50283 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd7P50283 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd7P50283 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd7P50283 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd7P50283 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd7P50283 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd7P50283 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd7P50283 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd7P50283 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd7P50283 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd7P50283 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd7P50283 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd7P50283 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd7P50283 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd7P50283 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd7P50283 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd7P50283 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd7P50283 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms