Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp9P49962 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp9P49962 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp9P49962 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp9P49962 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp9P49962 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp9P49962 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srp9P49962 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp9P49962 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srp9P49962 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srp9P49962 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srp9P49962 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp9P49962 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp9P49962 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp9P49962 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp9P49962 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Srp9P49962 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp9P49962 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Srp9P49962 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms