Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdkn1cP49919 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkn1cP49919 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdkn1cP49919 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdkn1cP49919 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdkn1cP49919 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkn1cP49919 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms