Protein–RNA interactions for Protein: P48320

Gad2, Glutamate decarboxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad2P48320 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gad2P48320 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gad2P48320 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gad2P48320 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gad2P48320 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gad2P48320 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gad2P48320 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gad2P48320 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gad2P48320 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gad2P48320 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gad2P48320 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gad2P48320 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gad2P48320 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad2P48320 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad2P48320 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gad2P48320 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad2P48320 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad2P48320 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad2P48320 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gad2P48320 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gad2P48320 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gad2P48320 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms