Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl11P48298 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl11P48298 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl11P48298 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl11P48298 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl11P48298 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl11P48298 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms