Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf9P41274 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf9P41274 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf9P41274 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf9P41274 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf9P41274 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf9P41274 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf9P41274 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms