Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik2P39087 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grik2P39087 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik2P39087 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik2P39087 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik2P39087 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik2P39087 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik2P39087 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik2P39087 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik2P39087 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik2P39087 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik2P39087 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik2P39087 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik2P39087 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik2P39087 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik2P39087 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik2P39087 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grik2P39087 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grik2P39087 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms